ユーザーを削除したらそのユーザーが登録した課題などはどうなりますか?

削除されたユーザが登録した課題や Wiki は削除されることなく、そのまま保持されます。

また、そのユーザが担当者となっている課題については担当者が消えることはありませんが、別のユーザに担当者を変更した場合は、削除されたユーザに担当を戻すことはできません。